اسباب تتعلق بالغدد التي تتحكم في انتاج الخصيتين : تاخر مرحلة نضوج الطفل الى رجل ، نقص انتاج هرمون L.H F.S.H للاسباب التالية : سبب خلقي مثال kallmann’s Syndrome الذي يكون مصاحبا لاضطراب في حاسة الشم ، اسباب اخرى تسبب تلف احد من الغدتين النخامية والهايبوثلاموس او كلتاهما :
كالتعرض لاصابة شديدة – التعرض الى اشعاع – الاصابة بورم – اجراء جراحي في الغدتين – اخذ ادوية تؤثر عليها. ارتفاع نسبة هرمون الحليب في جسم الرجل وقد يكون السبب في ذلك اصابة الغدة النخامية بورم او تاثر الغدة النخامية بدواء معين. – اصابة بالغدد الصماء غير واضحة الاعراض ، انّ قياس نسبة هرمونات Prolactin, LH, FSH, Testosterone يساعد على تشخيص سبب العقم عند الرجل.
وكمثال على ذلك عندما تكون نسبة هرمون الذكورة منخفضة ويرتفع هرمون FSH LH يدل على عجز الخصية الاولى ويكون غالبا مصاحبا لانعدام وجود الحيوانات المنويه في السائل المنوي او قلة انتاج الحيوانات المنويه ، اما عندما تكون نسبة هرمون الذكورة انف الذكر طبيعيا ونسبة مستقبلات هرمون LH منخفضة يؤدي بطريقة غير مباشرة الى عدم فعالية هرمون الذكورة في جسم الرجل.
اما عندما تكون نسبة انتاج هرمون الذكورة و FSH, LH كلها منخفضة فقد تكون هذه الحالة مصاحبة لانخفاض هرمونات اخرى في جسم الرجل مثل الهرمونات التي تفرز من الغدة النخامية Growth Hormone, TSH, Corticotropin. ويترك تشخيص السبب للطبيب المعالج ، اما عندما تكون نسبة هرمون الذكورة وهرمون FSH, LH طبيعية فيمكن ان هذا الرجل يعاني من القذف العكسي الذي سنشرح عنه لاحقا ، او انسداد في القنوات القاذفة ، اوخلل في الخلايا التي تنتج الحيوانات المنويه وينعكس تاثير الخلل في هذه الهرمونات بشكل عام على انتاج الحيوانات المنويه .